Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms