Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms