Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VITQ6UXI7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.3 ms