Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms