Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FREM1Q5H8C1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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