Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms