Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP21-2Q3LI59 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms