Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms