Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms