Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms