Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms