Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFKFB3Q16875 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms