Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms