Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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