Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.8 ms