Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIP10Q15642 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms