Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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