Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CDSNQ15517 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CDSNQ15517 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CDSNQ15517 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CDSNQ15517 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CDSNQ15517 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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