Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms