Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RABEP1Q15276 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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RABEP1Q15276 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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RABEP1Q15276 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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