Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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