Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms