Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAPVD1Q14C86 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAPVD1Q14C86 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
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