Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms