Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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CHD4Q14839 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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CHD4Q14839 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHD4Q14839 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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