Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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