Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PTPRCAPQ14761 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PTPRCAPQ14761 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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