Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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