Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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