Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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