Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms