Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF5Q13568 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms