Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AP3B2Q13367 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms