Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SGCGQ13326 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SGCGQ13326 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SGCGQ13326 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SGCGQ13326 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SGCGQ13326 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SGCGQ13326 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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SGCGQ13326 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SGCGQ13326 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SGCGQ13326 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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