Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms