Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms