Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms