Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms