Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms