Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms