Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms