Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms