Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HBBP68871 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HBBP68871 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HBBP68871 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms