Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2BP67870 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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