Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms