Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN8P56748 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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