Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASP9P55211 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASP9P55211 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASP9P55211 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms