Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ELLP55199 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ELLP55199 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ELLP55199 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ELLP55199 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ELLP55199 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ELLP55199 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms