Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms