Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms